ハマダ ヨシキ   Hamada Yoshiki
  濱田 良樹
   所属   鶴見大学  歯学部 歯学科 口腔顎顔面外科学
   職種   教授
研究期間 2018/04~2021/03
研究課題 完全個別化医療に向けた口腔癌のネオアンチゲンの探索および宿主免疫応答の網羅的解析
実施形態 科学研究費補助金
研究委託元等の名称 日本学術振興会
研究種目名 基盤研究(B)
科研費研究課題番号 18H03008
キーワード 口腔癌, 完全個別化医療, TCR, T細胞受容体, 口腔がん, ネオアンチゲン, T細胞受容体
代表者 濱田 良樹
概要 登録患者数が20名となった段階で, 検体の一部からDNAを抽出し, HLAタイピング(HLA-A, B, DR)を実施する. 次世代シーケンサーを用いて患者毎に腫瘍組織と正常組織のエクソーム解析とRNA-Seq解析を併用して腫瘍特異的体細胞遺伝子変異を同定し, 腫瘍におけるその遺伝子発現を確認する. 変異遺伝子産物のアミノ酸配列情報をもとに, 患者のMHCクラスI分子に結合して抗原提示される可能性がある8~11アミノ酸からなる変異ペプチド配列をネオエピトープとして予測する.